En aproximadamente el 80% de los cerdos machos no castrados, la acumulación de escatol [Patterson, RLS, 1968] y androstenona [Gower, DB, 1972] en la grasa dorsal provoca un olor desagradable a verraco.
La Metilación del ADN es un mecanismo epigenético importante que causa directamente una modificación química del ADN conferida por la transferencia covalente de un grupo metilo a la posición C-5 de la citosina. Desde su descubrimiento hace 40 años, la metilación se ha establecido como un factor epigenético importante que influye en las actividades de los genes.
La Metilación del ADN de diferentes componentes génicos, incluidos diferentes exones e intrones, o diferentes longitudes de exones e intrones, se asocia con diferencias en la expresión génica. Para investigar la metilación de los componentes del gen porcino asociados con el rasgo del Olor a Verraco, este estudio utilizó datos de secuenciación de Bisulfito de Representación Reducida – RRBS de nueve muestras de testículos porcinos en tres grupos de Olor a Verraco: Bajo, Medio y Alto.
Los resultados mostraron que los niveles de metilación de los primeros exones y primeros intrones eran más bajos que los de los otros exones e intrones. Los primeros exones/intrones de las regiones insulares CpG tenían niveles aún más bajos de metilación.
Se identificaron un total de 123 promotores metilados diferencialmente (DMP), 194 exones metilados diferencialmente (DME) y 402 intrones metilados diferencialmente (DMI), de los cuales 80 DMP (DMP-CpGis), se descubrieron 112 DME (DME-CpGis) y 166 DMI (DMI-CpGis) en islas CpG.
En tono rimbombante, GPX1 contenía uno de cada uno de DMP, DME, DMI, DMP-CpGi, DME-CpGi y DMI-CpGi. El análisis de las vías y relaciones de términos de Gene-GO mostró que los genes relacionados con DMP-CpGi están involucrados principalmente en funciones biológicas relacionadas con la metilación.
El hallazgo que los niveles decrecientes de metilación de los primeros exones estaban en una fuerte relación con los promotores, particularmente a través de interacciones con islas CpG, llamó nuestra atención porque podrían considerarse como una entidad del primer exón del promotor que regula los eventos biológicos.
Según los resultados de la red gen-gen, hipometilado GPX1 que une APP , ATOX1 , ADRB2 , RPS6KA1 y PNMT podrían usarse como posibles biomarcadores candidatos para el olor a verraco en cerdos después de una validación adicional en grandes poblaciones de la misma raza.