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14 Sep 2020
Análisis filogenético de cepas del virus hepatitis E de cerdos gordos en Colombia
El virus de la hepatitis E – HEV, es un virus zoonótico que causa hepatitis aguda en humanos y puede transmitirse por vía fecal-oral . Se considera que los cerdos son un reservorio de esta infección, principalmente cuando la enfermedad no es endémica.
El virus de la hepatitis E – HEV, es un virus zoonótico que causa hepatitis aguda en humanos y puede transmitirse por vía fecal-oral . Se considera que los cerdos son un reservorio de esta infección, principalmente cuando la enfermedad no es endémica.
Objetivo
En un estudio previo realizado en Antioquia, que es una región de Colombia donde la producción y consumo de carne de cerdo es mayor que en el resto del país, se reportó la presencia de anticuerpos tipo IgG anti-HEV en cerdos en edad de faena.
Método
Con el objetivo de identificar el genotipo HEV circulante en porcinos , hígado animal y heces, se recolectaron muestras de cinco mataderos de ganado porcino ubicados en seis subregiones diferentes de Antioquia. Una RT-PCR anidada(nRT-PCR) se utilizó para amplificar el HEV ORF-1 (170 pb) y ORF-2 (348 y 958 pb).
Se secuenciaron los amplicones producidos en este estudio y se realizó un análisis de filogenia molecular basado en el método de máxima verosimilitud , incluyendo secuencias de HEV reportadas en varios países.
Resultados
El análisis de filogenia reveló que los fragmentos de amplificación de HEV de los cerdos de Antioquia se agruparon en tres clados dentro del subgenotipo 3a sin una estructura geográfica específica, y también estaban genéticamente relacionados con secuencias de HEV japonesas y americanas.
Este análisis proporciona el primer acercamiento a la diversidad genética y dinámica de circulación de HEV en rebaños colombianos.
Conclusiones
1. Análisis de filogenia de HEV basado en el método de máxima verosimilitud
2. Este análisis proporciona el primer enfoque sobre la diversidad genética y la dinámica de circulación de las cepas de HEV colombianas.
3. El análisis de filogenia reveló que los fragmentos de HEV de los cerdos de Antioquia se agruparon en tres clados dentro del subgenotipo 3a.
