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Caracterización molecular de las cepas del PRRSV en China (2016-2017)

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El virus del Síndrome Reproductivo y Respiratorio Porcino (PRRSV) ocasiona una enfermedad muy contagiosa y provoca enormes pérdidas económicas en la producción comercial de carne de cerdo en todo el mundo. La infección por este virus provoca graves fallos reproductivos en las cerdas y trastornos respiratorios en los lechones.

Para conocer la situación epidemiológica de esta enfermedad en las granjas chinas, investigadores de la Universidad de Ciencia y Tecnología Agrícola de Jilin y Universidad Agrícola de Heilongjiang Bayi (China) han llevado a cabo un estudio sobre la evolución del PRRSV en cerdos con procesos respiratorios en algunas zonas de China entre 2016 y 2018. 

Se recolectaron 112 muestras de doce provincias chinas para su análisis por RT-PCR y el estudio filogenético de los genes Nsp2/ORF5 (ORFa).

Se realizaron análisis de secuencias y de recombinación en los genes Nsp2/ORF5 (ORF5a) de la cepa identificada en el estudio.

Los resultados de la RT-PCR mostraron que la tasa de positividad del PRRSV era del 50,89% (57/112), mientras que el análisis filogenético reveló que las cepas identificadas del PRRSV eran todas de genotipo NA y pertenecían a los linajes 1, 3 y 8.

Gen Nsp2

El gen Nsp2 de las cepas identificadas del PRRSV presentaba una homología de nucleótidos del 53,0 ~ 99,8%, y una homología de aminoácidos del 46,8 ~ 99,7%.

Todas las cepas identificadas en este estudio pueden ser cepas salvajes, y la mayoría de las cepas identificadas pueden ser cepas altamente virulentas.

Gen ORF5

El gen ORF5 de las cepas identificadas del PRRSV presentaba una homología de nucleótidos del 82,4 ~ 100%, y una homología de aminoácidos del 79,6 ~ 100%.

El análisis de la secuencia de ORF5 y ORF5a reveló que los puntos de mutación de GP5 se concentraban principalmente en la región del péptido señal y de los epítopos, mientras que los puntos de mutación de ORF5a se concentraban principalmente en la región transmembrana e intramembrana.

Recombinación 

El análisis de recombinación indicó que puede haber múltiples regiones de recombinación en las cepas identificadas, y que el patrón de recombinación es más complejo.

Este estudio evidenció que la cepa prevalente del PRRSV en algunas regiones de China seguía siendo el HP-PRRSV, mientras que la cepa NADC30 también ocupaba una cierta proporción; los diferentes tipos de cepas del PRRSV mostraban diferentes patrones y variaciones en China. En base a los resultados del estudio, se debe reforzar el seguimiento de la prevalencia y la variación genética del PRRSV.

Leer artículo completo: Yin, B., Qi, S., Sha, W., Qin, H., Liu, L., & Yun, J. et al. (2021). Molecular Characterization of the Nsp2 and ORF5 (ORF5a) Genes of PRRSV Strains in Nine Provinces of China During 2016–2018. Frontiers In Veterinary Science, 8. doi: 10.3389/fvets.2021.605832

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