Genes de resistencia bacteriano en lechones destetados: alta variabilidad y efecto del muestreo

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La vigilancia de la resistencia a antimicrobianos en producción porcina es una herramienta clave para comprender la dinámica del resistoma en granja y apoyar estrategias de uso responsable de antibióticos.

Un estudio reciente analiza la abundancia y evolución de genes de resistencia a antimicrobianos presentes en las bacterias intestinales de lechones destetados, poniendo el foco tanto en la variabilidad entre animales como en las diferencias derivadas del tipo de muestreo.

El trabajo se desarrolló en una explotación porcina de cebo en Brandeburgo (Alemania), donde se siguió durante ocho semanas a un lote de 33 lechones destetados de cuatro semanas de edad, alojados en un sistema de flat-deck.

A lo largo del periodo de estudio se recogieron semanalmente:

  • Muestras de heces frescas de animales marcados.
  • Muestras agrupadas procedentes del suelo de los corrales.

En total, se analizaron 103 muestras individuales y 53 muestras agrupadas a nivel de corral.

Para caracterizar el resistoma bacteriano, los autores combinaron dos aproximaciones moleculares.

  • Realizaron un cribado amplio de genes de resistencia mediante qPCR de alto rendimiento (SmartChip) en ADN combinado de muestras fecales.
  • Por otro, aplicaron qPCR convencional para cuantificar de forma precisa ocho genes de resistencia seleccionados (aadA1, blaTEM, dfrA12, erm(B), lnu(F), qnrS, sul2 y tet(A)), normalizando los resultados frente al gen 16S rRNA como indicador de la carga bacteriana total.

Entre los genes cuantificados, erm(B) y aadA1 mostraron las mayores abundancias relativas, mientras que qnrS fue el menos frecuentemente detectado.

Un resultado destacado del estudio fue la amplia variabilidad interindividual observada en la abundancia de genes de resistencia bacterianos, incluso entre lechones alojados en las mismas condiciones de manejo.

Esta variabilidad se mantuvo a lo largo del tiempo, mientras que los niveles del gen 16S rRNA permanecieron relativamente estables, lo que indica que las diferencias reflejan cambios en el resistoma bacteriano y no únicamente fluctuaciones en la biomasa microbiana.

El tipo de muestra tuvo un impacto claro en los resultados. Las muestras agrupadas recogidas del suelo del corral presentaron cargas significativamente más altas de varios genes de resistencia —entre ellos blaTEM, lnu(F), sul2, tet(A) y aadA1— en comparación con las heces frescas individuales.

Este hallazgo indica que el perfil de genes de resistencia a nivel de corral no puede inferirse de forma fiable a partir de muestras individuales, probablemente debido a la acumulación y mezcla de bacterias procedentes de distintos animales y momentos.

El análisis temporal mostró que, a medida que avanzaba el periodo postdestete, aumentaban las copias del gen 16S rRNA, mientras que algunos genes de resistencia como tet(A) y sul2 disminuían en la segunda mitad del estudio, lo que sugiere un efecto asociado a la edad y a la adaptación progresiva del microbioma intestinal tras el destete.

Durante el estudio, algunos lechones recibieron tratamiento antibiótico con amoxicilina por indicación veterinaria y con fines estrictamente terapéuticos. Aunque se observaron descensos puntuales en la abundancia de determinados genes tras el tratamiento, los autores señalan que tendencias similares se detectaron también en animales no tratados, lo que apunta a que los cambios observados están más relacionados con factores temporales y de desarrollo que con el tratamiento antibiótico en sí.

En conjunto, el trabajo pone de manifiesto la complejidad del resistoma bacteriano en lechones destetados y subraya la importancia de considerar tanto la variabilidad individual como el tipo de muestreo en los programas de vigilancia de la resistencia a antimicrobianos en porcino.

Leer estudio completo: Jaleta, M., Junker, V., Hölzel, C., Zentek, J., Amon, T., Nübel, U., Kabelitz, T. (2026). Antimicrobial resistance genes in weaned pigs: quantitative abundance and group dynamics assessed by qPCR. Frontiers in Veterinary Science, 12, 1709227. https://doi.org/10.3389/fvets.2025.1709227

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