La patogénesis y los factores de virulencia de M. hyopneumoniae no son del todo conocidos, pero se sabe que la NADH oxidasa (NOX) es un importante factor de virulencia de la bacteria, participando en la interacción entre hospedador y patógeno. No obstante, la función de NOX en la patogénesis de M. hyopneumoniae no está del todo clara.