Recombinación interespecífica en el gen NSP3 de rotavirus H

PORCISAPIENS| | Noticias

Durante la última década, el rotavirus porcino H (RVH) se ha detectado en EE.UU., regiones asiáticas, Sudáfrica, Brasil y algunos países europeos.

En el estudio presentado por investigadores del Centro Científico Federal VIEV (FSC VIEV), el virus se ha identificó en lechones de una granja de engorde en Rusia a través de un programa de vigilancia metagenómica, tratándose de la primera identificación de esta especie en el país.

El diagnóstico se realizó mediante secuenciación metagenómica basada en nanoporos cuyas lecturas permitieron ensamblar 10 de los 11 segmentos del genoma.

El análisis filogenético reveló que el virus pertenecía al clúster porcino y tenía la constelación genómica GX-P3-I3-R3-C3-M8-A7-N1-T5-E3-H3.

Se determinaron tres posibles nuevos grupos de genotipos para los genes VP3, NSP1 y NSP3, detectándose una recombinación entre RVH y RVC en el gen NSP3. En este sentido el estudio aporta información relevante sobre una nueva cepa de RVH.

Leer estudio completo: Krasnikov, N. and Yuzhakov, A. (2023) ‘Interspecies recombination in NSP3 gene in the first porcine rotavirus H in Russia identified using nanopore-based metagenomic sequencing’, Frontiers in Veterinary Science [Preprint]. doi:10.3389/fvets.2023.1302531.

Te puede interesar:

Detección y caracterización genética de virus entéricos en brotes de diarrea de explotaciones porcinas en España

PDF