Los virus de la influenza porcina (IP) pertenecen al género Influenzavirus tipo A de la familia Orthomyxoviridae. Estos virus se subclasifican en base a las glicoproteínas de superficie: la hemaglutinina (H= 
La combinación de un tipo de H con un tipo de N es lo que define a lo que conocemos como subtipo.
Los subtipos mayoritarios en el cerdo son el H1N1, el H1N2 y el H3N2, aunque se han detectado otros de forma esporádica (H3N1, H3N3, H9N2, etc).
La clasificación por subtipos nos es útil para poder simplificar y entender la epidemiología y diversidad de los virus de la influenza; sin embargo, las características evolutivas de estos virus (sometidos a la deriva y reordenación genética) hacen que esta clasificación sea insuficiente.
En Europa se pueden distinguir como mínimo 3 linajes distintos de H1 y uno de H3.
- En primer lugar, encontramos los relacionados con los H1N1 tipo aviar (H1avN1) introducidos a partir de aves migratorias a finales de la década de los 70.
- En segundo lugar, los relacionados con los H1N2 (H1huN2) que aparecen a mediados de la década de los 90 a partir de la combinación de un virus humano y virus porcinos.
- Finalmente, en tercer lugar, se detectan los virus relacionados con el H1N1 pandémico (H1N1pdm), introducidos justo después de la pandemia de 2009.
El tipo de hemaglutinina (H1av H1hu H1pdm) tiene mayor importancia que el propio subtipo a la hora de predecir si se producirá o no reacción cruzada entre dos virus.
Como podemos ver, en Europa encontramos tres tipos mayoritarios de H1, y presentan nula o mínima reactividad antigénica cruzada.
No obstante, cuando se produce la reordenación o intercambio genético entre dos de estos virus, por ejemplo H1avN1 con H1huN2, el virus resultante H1avN2 en este caso presentará reactividad cruzada con el ancestro co...
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