La investigación del microbioma intestinal porcino se ha centrado históricamente en las poblaciones bacterianas, mientras que la fracción viral ha recibido mucha menos atención.
Dentro de este viroma intestinal, los fagos jumbo —bacteriófagos con genomas de gran tamaño— representan un grupo especialmente interesante por su capacidad para codificar funciones complejas que pueden influir en el metabolismo de sus hospedadores y en la dinámica del ecosistema microbiano.
Un reciente estudio aborda esta laguna de conocimiento mediante un análisis genómico a gran escala.
El trabajo identificó 1.545 genomas de fagos jumbo a partir del análisis de 450 metagenomas intestinales de cerdos, lo que supone una de las caracterizaciones más amplias realizadas hasta la fecha sobre este grupo viral en el cerdo.
Los análisis filogenéticos, combinados con la comparación de proteínas ortólogas, respaldan la propuesta de 14 nuevas familias de fagos jumbo, poniendo de manifiesto una diversidad genética mucho mayor de la que se conocía hasta ahora.
Desde el punto de vista funcional, diez de estas familias contienen genes metabólicos auxiliares (AMGs), capaces de modular procesos metabólicos del hospedador durante la infección.
Además, los genomas de estos fagos incluyen diversos sistemas relacionados con la evasión o contrarresto de las defensas bacterianas, como metiltransferasas de ADN, endonucleasas HNH y glicosiltransferasas.
El estudio también profundiza en las relaciones ecológicas entre fagos jumbo mediante redes de co-abundancia y coincidencias de espaciadores CRISPR, identificando cientos de asociaciones entre fagos recientemente descritos y otros fagos jumbo ya conocidos.
| El microbioma intestinal debe entenderse como un ecosistema complejo en el que los virus, y en particular los fagos jumbo, desempeñan un papel relevante. Aunque el estudio no aborda aplicaciones prácticas directas, amplía de forma significativa el conocimiento básico sobre el viroma porcino y sienta las bases para futuras investigaciones sobre su posible impacto en la salud intestinal y el metabolismo del cerdo. |
Leer estudio completo: WeiZhe C., Zhe C. Comprehensive genome analysis uncovers the diversity of jumbo phages in the pig gut microbiome. Frontiers in Veterinary Science, sección Animal Nutrition and Metabolism.
Te puede interesar: Colibacilosis y desmedicalización en la producción porcina: ¿Es la fagoterapia una nueva alternativa de control?
Genes de resistencia bacteriano en lechones destetados: alta variabilidad y efecto del muestreo
Escherichia coli F18: nueva evidencia sobre la diarrea postdestete sin daño intestinal temprano
RECOMENDADO
