La microbiota intestinal (MGI) es una comunidad de microorganismos del tracto gastrointestinal que juntos tienen una relación simbiótica con el huésped.
El genoma de la MGI (microbioma) está considerado el segundo genoma de animales y personas.
Los tipos de microorganismos que forman la MGI desempeñan un papel fundamental en la salud y el rendimiento de los animales participando en el desarrollo y mantenimiento del sistema inmunológico, o en la digestión y recolección de energía y otros procesos como el metabolismo de los nutrientes (Round & Mazmanian, 2009; Turnbaugh et al., 2006).
No obstante, hasta hace poco, el campo de la microbiología estaba limitado por la falta de herramientas de investigación y una incapacidad para cultivar y estudiar la mayoría de los microbios presentes en el tracto gastrointestinal.
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En los últimos años, el desarrollo biotecnológico ha permitido la disponibilidad de métodos de secuenciación de alto rendimiento basados en ADN y ARN, que junto con nuevos desarrollos bioinformáticos permiten la identificación y caracterización de microbios y sus genes in situ.
En porcino, el estudio del MGI ha suscitado un gran interés en la comunidad científica debido a que es el alimento de origen animal que más se consume a nivel mundial y, por tanto, tiene una gran importancia para la seguridad alimentaria y medio ambiental.
Sin olvidar también que el cerdo es la especie modelo más parecida al humano en su sistema digestivo.
El uso de la información de la MGI en porcino podría ser muy útil a nivel práctico (Figura 1).
Sin embargo, hay una gran variedad de perfiles microbianos entre individuos y, ...